O Mangekyou Sharingan é a evolução do sharingan adquirida quando o usuario presencia a morte de alguém
importante ou tem um grande sentimento de culpa(ou outro motivos ainda não esclareçidos na historia)

o Mangekyõ Sharingan tem três Jutsus especiais:

Susano'o:O deus do mar,Tem duas formas,a completa(que Itachi usa em sua batalha contra Sasuke Uchiha),e a incompleta(Que Sasuke usa algum tempo após o dominio do Mangekyõ Sharingan)

Amaterasu:O deus do sol,esse Jutsu,tem um grande poder de destruição,quando ativado leva os olhos do usuario á sangrarem,as chamas do Amaterasu,são mais quentes que o sol,e ficam acessas por 7 dias e 7 noites(a não ser que alguem use um Jutsu especial para apaga-las),qualquer usuario do Mangekyõ Sharingan pode usa-lo,mas Itachi é o que melhor as domina.

Tsukuyomi:O deus da Lua,quando seu usuario o ativa,leva uma vitima para um reino,onde essa é torturada por 72 horas sem parar,qualquer usuario do Mangekyou Sharingan é capaz de usa-la,mas Itachi é o que melhor as domina.
e o pequeno quadrado de baixo é a estreia do verdadeiro Mangekyo Sharingham